Het bestuur van de Vereniging Artsen zonder Grenzen zorgt ervoor dat de directie het overeengekomen beleid uitvoert. Daarnaast bewaakt het bestuur onze identiteit. Statutair is het bestuur van de Vereniging Artsen zonder Grenzen samengesteld uit minimaal zeven leden die worden gekozen door de Algemene Ledenvergadering. Het bestuur kiest jaarlijks zijn voorzitter uit de gekozen bestuursleden.